Fall 1994

En 2010, le gouvernement des Nations unies de la Terre a mis fin à la Ière Guerre Spatiale avec les géants Zentradi. La Terre étant ravagée, des flottes coloniales destinées à trouver de nouveaux mondes habitables sont envoyées aux quatre coins de la galaxie régulièrement.
Nous sommes en 2045. Cela fait sept ans que la 37e flotte d’émigration commandée par le New-Macross 7 se dirige vers le centre de la Voie lactée. Alors que la flotte s’approche du système solaire de Varauta, elle est attaquée par un étrange ennemi dont les appareils ressemblent étrangement à ceux utilisés par les Nations Unies. Les Protodeviln utilisent un rayon absorbant l’énergie vitale des humains, la spiritia, ce qui plonge les victimes dans un état comateux. L’armée est complètement dépassée par les évènements. Le seul espoir semble provenir d’un groupe de rock et de son chanteur, Nekki Basara, dont les chansons, comme celles de Lynn Minmay, perturbent les ennemis.

Alors qu’elles visitent tranquillement la Tour de Tokyo avec leurs écoles respectives, Shidô Hikaru, Ryûzaki Umi et Hôôji Fû sont invoquées par la princesse Emeraude pour devenir des Magic Knights et sauver le monde de Cefiro. Téléportées sur ce dernier qui sombre dans le chaos depuis que son pilier, la princesse Emeraude, a été enlevé par le grand prêtre Zagato, nos trois héroïnes rencontrent le mage Clef qui leur explique en partie la situation. Grâce à leur indéfectible amitié et après avoir surmonté de terribles épreuves, Hikaru, Umi et Fû réussissent à trouver l’Escudo, un minerai très spécial qui permet au maître forgeron Presea de leurs forger des armes évolutives. Elles repartent alors à la recherche de la Garde Sacrée pour devenir des Magic Knights. Mais sur leur chemin, de redoutables ennemis à la solde de Zagato les attendent, fermement résolus à les éliminer…